Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RAP15509 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RAP15509 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 626 ms