Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM27P14373 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM27P14373 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms