Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNT1P13805 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNT1P13805 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNNT1P13805 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms