Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCP1P13796 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCP1P13796 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCP1P13796 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCP1P13796 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCP1P13796 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCP1P13796 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCP1P13796 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCP1P13796 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCP1P13796 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCP1P13796 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCP1P13796 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCP1P13796 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCP1P13796 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCP1P13796 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCP1P13796 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LCP1P13796 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCP1P13796 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCP1P13796 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCP1P13796 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCP1P13796 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCP1P13796 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCP1P13796 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCP1P13796 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCP1P13796 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCP1P13796 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCP1P13796 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCP1P13796 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCP1P13796 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCP1P13796 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCP1P13796 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCP1P13796 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCP1P13796 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCP1P13796 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCP1P13796 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCP1P13796 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCP1P13796 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCP1P13796 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCP1P13796 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCP1P13796 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCP1P13796 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCP1P13796 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCP1P13796 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCP1P13796 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCP1P13796 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCP1P13796 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCP1P13796 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCP1P13796 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCP1P13796 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms