Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM1P13688 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms