Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P4HA1P13674 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4HA1P13674 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P4HA1P13674 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms