Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDRP11473 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VDRP11473 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VDRP11473 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VDRP11473 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VDRP11473 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VDRP11473 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VDRP11473 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VDRP11473 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VDRP11473 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VDRP11473 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VDRP11473 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VDRP11473 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VDRP11473 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VDRP11473 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VDRP11473 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VDRP11473 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDRP11473 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDRP11473 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDRP11473 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDRP11473 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDRP11473 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDRP11473 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDRP11473 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDRP11473 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VDRP11473 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VDRP11473 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VDRP11473 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VDRP11473 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VDRP11473 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VDRP11473 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VDRP11473 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VDRP11473 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VDRP11473 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VDRP11473 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VDRP11473 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VDRP11473 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VDRP11473 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VDRP11473 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VDRP11473 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VDRP11473 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VDRP11473 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VDRP11473 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VDRP11473 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VDRP11473 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VDRP11473 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDRP11473 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VDRP11473 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VDRP11473 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VDRP11473 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VDRP11473 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VDRP11473 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VDRP11473 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDRP11473 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDRP11473 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDRP11473 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDRP11473 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDRP11473 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VDRP11473 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDRP11473 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDRP11473 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDRP11473 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDRP11473 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 649.3 ms