Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV3-30-5P0DP03 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms