Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC175P0C221 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC175P0C221 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms