Protein–RNA interactions for Protein: P09848

LCT, Lactase-phlorizin hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 1,927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTP09848 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCTP09848 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCTP09848 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LCTP09848 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCTP09848 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LCTP09848 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LCTP09848 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LCTP09848 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LCTP09848 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LCTP09848 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LCTP09848 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LCTP09848 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LCTP09848 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCTP09848 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCTP09848 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCTP09848 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCTP09848 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCTP09848 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCTP09848 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCTP09848 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCTP09848 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LCTP09848 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCTP09848 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCTP09848 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCTP09848 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCTP09848 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCTP09848 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCTP09848 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LCTP09848 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCTP09848 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCTP09848 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCTP09848 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCTP09848 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCTP09848 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LCTP09848 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCTP09848 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCTP09848 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCTP09848 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LCTP09848 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LCTP09848 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCTP09848 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LCTP09848 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LCTP09848 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCTP09848 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCTP09848 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCTP09848 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCTP09848 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCTP09848 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCTP09848 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCTP09848 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCTP09848 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCTP09848 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCTP09848 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCTP09848 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCTP09848 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCTP09848 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCTP09848 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCTP09848 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCTP09848 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCTP09848 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCTP09848 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCTP09848 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCTP09848 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCTP09848 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCTP09848 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCTP09848 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCTP09848 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCTP09848 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LCTP09848 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCTP09848 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCTP09848 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCTP09848 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCTP09848 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCTP09848 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCTP09848 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCTP09848 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCTP09848 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCTP09848 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCTP09848 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCTP09848 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms