Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LDHBP07195 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LDHBP07195 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHBP07195 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHBP07195 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHBP07195 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHBP07195 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHBP07195 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHBP07195 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHBP07195 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHBP07195 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHBP07195 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHBP07195 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHBP07195 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHBP07195 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHBP07195 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHBP07195 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHBP07195 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHBP07195 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHBP07195 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHBP07195 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHBP07195 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHBP07195 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHBP07195 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHBP07195 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHBP07195 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHBP07195 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDHBP07195 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDHBP07195 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHBP07195 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHBP07195 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHBP07195 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHBP07195 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHBP07195 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHBP07195 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHBP07195 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHBP07195 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHBP07195 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHBP07195 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHBP07195 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHBP07195 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHBP07195 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHBP07195 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHBP07195 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHBP07195 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHBP07195 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHBP07195 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHBP07195 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHBP07195 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHBP07195 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHBP07195 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms