Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT18P05783 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT18P05783 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT18P05783 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT18P05783 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT18P05783 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT18P05783 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT18P05783 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT18P05783 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT18P05783 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT18P05783 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT18P05783 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT18P05783 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT18P05783 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT18P05783 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT18P05783 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT18P05783 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT18P05783 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT18P05783 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT18P05783 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT18P05783 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT18P05783 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT18P05783 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT18P05783 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT18P05783 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT18P05783 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT18P05783 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT18P05783 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT18P05783 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT18P05783 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT18P05783 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT18P05783 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT18P05783 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT18P05783 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT18P05783 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT18P05783 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT18P05783 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT18P05783 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT18P05783 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT18P05783 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT18P05783 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT18P05783 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT18P05783 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT18P05783 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT18P05783 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT18P05783 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT18P05783 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT18P05783 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms