Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB1P05556 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms