Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCCAP05165 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCCAP05165 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCCAP05165 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCCAP05165 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCCAP05165 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCCAP05165 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCCAP05165 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCCAP05165 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCCAP05165 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCCAP05165 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCCAP05165 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCCAP05165 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCCAP05165 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCCAP05165 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCCAP05165 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCCAP05165 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCCAP05165 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCCAP05165 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCCAP05165 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCCAP05165 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCCAP05165 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCCAP05165 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCCAP05165 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCCAP05165 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCCAP05165 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCCAP05165 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCCAP05165 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCCAP05165 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCCAP05165 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCCAP05165 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCCAP05165 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCCAP05165 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCCAP05165 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCCAP05165 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCCAP05165 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCCAP05165 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCCAP05165 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCCAP05165 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCCAP05165 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCCAP05165 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCCAP05165 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCCAP05165 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCCAP05165 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCCAP05165 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCCAP05165 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCCAP05165 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCCAP05165 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCCAP05165 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCCAP05165 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCCAP05165 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCCAP05165 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCCAP05165 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCCAP05165 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms