Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6BP04259 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms