Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA1P02647 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA1P02647 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA1P02647 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA1P02647 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA1P02647 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA1P02647 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA1P02647 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA1P02647 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA1P02647 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA1P02647 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA1P02647 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOA1P02647 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOA1P02647 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOA1P02647 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOA1P02647 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOA1P02647 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOA1P02647 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA1P02647 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA1P02647 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA1P02647 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA1P02647 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA1P02647 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA1P02647 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA1P02647 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA1P02647 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms