Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CST3P01034 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CST3P01034 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST3P01034 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST3P01034 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST3P01034 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST3P01034 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST3P01034 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CST3P01034 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CST3P01034 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CST3P01034 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CST3P01034 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CST3P01034 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CST3P01034 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CST3P01034 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CST3P01034 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CST3P01034 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CST3P01034 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CST3P01034 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST3P01034 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST3P01034 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST3P01034 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST3P01034 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST3P01034 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST3P01034 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CST3P01034 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST3P01034 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CST3P01034 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST3P01034 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST3P01034 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST3P01034 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST3P01034 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST3P01034 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST3P01034 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST3P01034 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CST3P01034 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CST3P01034 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST3P01034 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST3P01034 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST3P01034 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST3P01034 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST3P01034 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST3P01034 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST3P01034 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST3P01034 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CST3P01034 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CST3P01034 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CST3P01034 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CST3P01034 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CST3P01034 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CST3P01034 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CST3P01034 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CST3P01034 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CST3P01034 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CST3P01034 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CST3P01034 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CST3P01034 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CST3P01034 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms