Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F2P00734 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F2P00734 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
F2P00734 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
F2P00734 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
F2P00734 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
F2P00734 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
F2P00734 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
F2P00734 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
F2P00734 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F2P00734 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F2P00734 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F2P00734 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F2P00734 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
F2P00734 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F2P00734 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
F2P00734 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F2P00734 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
F2P00734 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F2P00734 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F2P00734 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
F2P00734 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F2P00734 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F2P00734 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
F2P00734 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F2P00734 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
F2P00734 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F2P00734 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F2P00734 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F2P00734 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F2P00734 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F2P00734 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
F2P00734 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F2P00734 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F2P00734 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F2P00734 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F2P00734 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F2P00734 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F2P00734 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F2P00734 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
F2P00734 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F2P00734 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F2P00734 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F2P00734 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F2P00734 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F2P00734 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F2P00734 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F2P00734 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F2P00734 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F2P00734 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F2P00734 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
F2P00734 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F2P00734 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
F2P00734 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F2P00734 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F2P00734 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F2P00734 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F2P00734 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms