Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSL3O95573 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSL3O95573 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSL3O95573 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms