Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24AO95486 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24AO95486 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms