Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCGO76070 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCGO76070 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCGO76070 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCGO76070 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCGO76070 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCGO76070 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCGO76070 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCGO76070 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCGO76070 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms