Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN3O75935 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN3O75935 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms