Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPM3O75607 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPM3O75607 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPM3O75607 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPM3O75607 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPM3O75607 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPM3O75607 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPM3O75607 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPM3O75607 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NPM3O75607 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NPM3O75607 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPM3O75607 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPM3O75607 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPM3O75607 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NPM3O75607 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NPM3O75607 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPM3O75607 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPM3O75607 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPM3O75607 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPM3O75607 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPM3O75607 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPM3O75607 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPM3O75607 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPM3O75607 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPM3O75607 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NPM3O75607 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPM3O75607 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPM3O75607 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPM3O75607 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPM3O75607 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPM3O75607 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPM3O75607 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPM3O75607 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPM3O75607 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPM3O75607 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPM3O75607 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPM3O75607 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPM3O75607 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPM3O75607 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NPM3O75607 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM3O75607 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPM3O75607 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms