Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG13O75143 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG13O75143 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG13O75143 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG13O75143 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG13O75143 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG13O75143 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG13O75143 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG13O75143 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG13O75143 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG13O75143 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG13O75143 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG13O75143 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG13O75143 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG13O75143 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG13O75143 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG13O75143 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG13O75143 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG13O75143 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG13O75143 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG13O75143 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG13O75143 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG13O75143 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG13O75143 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG13O75143 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG13O75143 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG13O75143 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG13O75143 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG13O75143 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG13O75143 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG13O75143 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG13O75143 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG13O75143 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG13O75143 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms