Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSVO60911 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSVO60911 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSVO60911 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSVO60911 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSVO60911 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSVO60911 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSVO60911 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSVO60911 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSVO60911 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSVO60911 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSVO60911 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSVO60911 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSVO60911 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSVO60911 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSVO60911 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSVO60911 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTSVO60911 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTSVO60911 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTSVO60911 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTSVO60911 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSVO60911 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSVO60911 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSVO60911 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSVO60911 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSVO60911 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSVO60911 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTSVO60911 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSVO60911 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSVO60911 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSVO60911 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSVO60911 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSVO60911 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSVO60911 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSVO60911 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSVO60911 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTSVO60911 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSVO60911 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSVO60911 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSVO60911 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTSVO60911 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSVO60911 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSVO60911 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSVO60911 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSVO60911 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSVO60911 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSVO60911 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSVO60911 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSVO60911 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSVO60911 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSVO60911 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSVO60911 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSVO60911 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSVO60911 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSVO60911 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSVO60911 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSVO60911 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSVO60911 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSVO60911 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms