Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL41O60662 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms