Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8B3O60423 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP8B3O60423 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms