Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH6O60337 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH6O60337 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH6O60337 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms