Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCA5O60264 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA5O60264 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms