Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL3O43909 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL3O43909 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms