Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOPO43791 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOPO43791 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOPO43791 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOPO43791 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPOPO43791 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOPO43791 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOPO43791 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOPO43791 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPOPO43791 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPOPO43791 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPOPO43791 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPOPO43791 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPOPO43791 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOPO43791 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOPO43791 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOPO43791 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOPO43791 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOPO43791 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOPO43791 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOPO43791 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPOPO43791 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOPO43791 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOPO43791 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOPO43791 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOPO43791 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOPO43791 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPOPO43791 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPOPO43791 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPOPO43791 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOPO43791 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOPO43791 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOPO43791 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOPO43791 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOPO43791 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPOPO43791 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOPO43791 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOPO43791 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOPO43791 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOPO43791 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOPO43791 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOPO43791 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPOPO43791 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOPO43791 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOPO43791 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOPO43791 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOPO43791 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOPO43791 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms