Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA3O43365 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms