Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms