Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2DO15514 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms