Protein–RNA interactions for Protein: O15247

CLIC2, Chloride intracellular channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC2O15247 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLIC2O15247 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC2O15247 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms