Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A1O15245 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A1O15245 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms