Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1CO15160 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms