Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBTB39O15060 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBTB39O15060 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBTB39O15060 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBTB39O15060 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBTB39O15060 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBTB39O15060 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBTB39O15060 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBTB39O15060 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBTB39O15060 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBTB39O15060 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms