Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIMBP2O15034 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIMBP2O15034 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIMBP2O15034 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms