Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOP56O00567 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOP56O00567 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP56O00567 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP56O00567 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP56O00567 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP56O00567 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP56O00567 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP56O00567 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOP56O00567 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP56O00567 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP56O00567 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP56O00567 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP56O00567 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP56O00567 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP56O00567 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP56O00567 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP56O00567 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOP56O00567 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP56O00567 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP56O00567 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP56O00567 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP56O00567 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP56O00567 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP56O00567 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NOP56O00567 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOP56O00567 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOP56O00567 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP56O00567 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP56O00567 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP56O00567 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP56O00567 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP56O00567 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP56O00567 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP56O00567 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP56O00567 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOP56O00567 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOP56O00567 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOP56O00567 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP56O00567 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP56O00567 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP56O00567 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP56O00567 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP56O00567 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP56O00567 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP56O00567 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOP56O00567 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms