Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBAG9O00559 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBAG9O00559 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EBAG9O00559 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms