Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3FO00303 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms