Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFXAPO00287 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFXAPO00287 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
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