Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF4O00268 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4O00268 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4O00268 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4O00268 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4O00268 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4O00268 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4O00268 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4O00268 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4O00268 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF4O00268 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF4O00268 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4O00268 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4O00268 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4O00268 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF4O00268 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4O00268 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4O00268 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4O00268 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4O00268 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4O00268 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4O00268 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4O00268 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4O00268 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4O00268 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4O00268 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4O00268 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4O00268 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF4O00268 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF4O00268 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4O00268 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4O00268 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4O00268 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4O00268 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4O00268 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4O00268 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4O00268 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4O00268 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4O00268 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4O00268 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4O00268 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4O00268 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4O00268 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4O00268 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4O00268 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms