Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3QQQ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
J3QQQ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QQQ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
J3QQQ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QQQ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QQQ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QQQ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms