Protein–RNA interactions for Protein: I3L0E3

hCG_1984214, HCG1984214, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_1984214I3L0E3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
hCG_1984214I3L0E3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
hCG_1984214I3L0E3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
hCG_1984214I3L0E3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms