Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BRM9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3BRM9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3BRM9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3BRM9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3BRM9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3BRM9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3BRM9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3BRM9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3BRM9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3BRM9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3BRM9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3BRM9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3BRM9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3BRM9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3BRM9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H3BRM9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BRM9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BRM9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BRM9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BRM9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BRM9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BRM9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BRM9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H3BRM9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms