Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8VP50 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8VP50 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8VP50 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8VP50 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F8VP50 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
F8VP50 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F8VP50 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
F8VP50 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8VP50 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8VP50 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8VP50 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
F8VP50 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8VP50 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8VP50 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F8VP50 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
F8VP50 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
F8VP50 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
F8VP50 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F8VP50 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F8VP50 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F8VP50 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F8VP50 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F8VP50 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F8VP50 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F8VP50 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VP50 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VP50 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VP50 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VP50 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VP50 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VP50 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VP50 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VP50 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F8VP50 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F8VP50 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F8VP50 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F8VP50 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VP50 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VP50 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VP50 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VP50 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F8VP50 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms