Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMO7DNF2Z398 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMO7DNF2Z398 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO7DNF2Z398 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms