Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PMD0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PMD0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PMD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PMD0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PMD0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PMD0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PMD0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PMD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PMD0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PMD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PMD0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PMD0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PMD0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PMD0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PMD0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PMD0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PMD0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PMD0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PMD0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PMD0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PMD0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PMD0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PMD0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PMD0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PMD0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PMD0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PMD0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PMD0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PMD0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PMD0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PMD0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E9PMD0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E9PMD0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E9PMD0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E9PMD0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E9PMD0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E9PMD0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PMD0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PMD0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PMD0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PMD0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PMD0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PMD0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PMD0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PMD0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PMD0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PMD0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PMD0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PMD0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PMD0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PMD0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PMD0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PMD0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PMD0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PMD0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PMD0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PMD0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PMD0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PMD0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PMD0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PMD0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E9PMD0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PMD0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PMD0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PMD0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PMD0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PMD0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PMD0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms